五區國稅局將在4月啟動營業稅選案查核，預估至少3萬家企業會被查稅。國稅局官員提醒，營業人可先自我檢視帳簿憑證，若有短漏報營業稅，只要於輔導期間內自動補報補繳，可適用稅捐稽徵法第48條之1免予處罰規定。
國稅局主要是運用營業稅資料庫查核系統，與營利事業所得稅結算申報資料進行比對，再針對異常案件進行查核，以檢視營利事業漏報收入、銷貨額或虛報進貨成本的情況。由於各區產業性質不同，各區國稅局選案標準也會有一些差異。
財政部中區國稅局指出，為遏止逃漏稅，維護租稅公平，將針對營業人（包含經營網路購物業者）六大異常情形選案查核，一是取具或開立不實統一發票；二是將不得扣抵進項稅額申報扣抵、申報免稅比率偏高，或應稅銷售額誤開立免稅統一發票。三是漏進、漏銷或進項金額巨大且加值率偏低；四是開立二聯式（含收銀機）統一發票的營業人未據實申報銷售額；五是購買國外勞務未依規定報繳營業稅；六是將不得適用零稅率銷售額申報適用零稅率者。
中區國稅局強調，對透過網路銷售貨物或勞務的個人或營業人將加強查核，因此納稅義務人如有未依規定辦理稅籍登記，或實際營業情形與稅籍登記資料不符，短漏開統一發票、短漏報稅額等，應儘速向所轄稽徵機關辦理設立或變更登記及補報補繳。
舉例來說，其中較常見的樣態，包括個人以營利為目的，採進、銷貨方式經營，無實體店面且無其他對外營業的固定場所，利用網路銷售貨物或勞務，每月銷售額已達營業稅起徵點，未辦理稅籍登記。
另外，還有營業人利用網路銷售貨物或勞務，未開立統一發票、未取具進項憑證或虛報進項稅額。經營網路交易且為查定課徵營業稅營業人，未按季覈實提供每月銷售額，或提供資料不實。
國稅局官員還指出，個人自境外購物網站進口貨物，低報進口完稅價格，轉而利用網路銷售，未辦理稅籍登記，涉嫌漏進漏銷。或是營業人以個人名義進口貨物，轉而利用網路銷售，涉嫌漏進漏銷。
